Fat32Formatter Probleme de formatage

Bonjours à tous,

J'ai fait une grosse gaffe, en effet je voulais reformater un disque dure externe en fat32 grâce au logiciel Fat32Formatter seulement je me suis trompé dans le choix du disque dure et j'ai sélectionner le disque dure de mon ordinateur qui est en NTFS sous Vista j'ai appuié sur "update info" puis "Initialize drive" et la plus rien ne bouge. Lorsque je redémarre l'ordinateur il ne trouve plus windows pourtant grâce au ms-dos j'ai pu voir que tout était encore là.
Je voulais donc savoir si il y avait un moyen pour rétablir mon erreur ou si je doit tout reinstaller?

Merci d'avance