Problème d'envoi avec Filezilla 3.0.0

Bonjour à tous,
J'ai un problème avec les 2 dernières versions de Filezilla.
Alors que tout fonctionnait bien jusqu'alors, je ne parviens plus à envoyer des fichiers complets sur mon site (des power point et des pdf).
J'envoie mon fichier normalement et une fois arrivé vers 80%, il me demande si je veux remplacer le fichier, le remplacer si plus récent, etc. comme si je renvoyais une nouvelle fois le fichier. Le problème c'est que le fichier final, du même coup, n'est jamais envoyé complétement.
Je ne comprend vraiment pas pourquoi ça me fait ça alors que sur d'anciennes versions (à part celle qui a tout juste précédé la 3.0, qui elle me faisait la même misère) je n'avais pas de problème.
Pouvez-vous m'aider ?