Salut,
Non, tu n'as rien à gagner (en qualité du moins) si tu passes d'un format avec perte type mp3 vers 1 format lossless type FLAC.
Au contraire même, car en "décompressant" un fichier compressé avec perte, on risque d'affecter davantage la qualité (de très légèrement à sensiblement, selon les formats et contenus de départ et "d'arrivée").
Au mieux ça ne changera rien, au pire tu peux même avoir une légère dégradation.
EDIT : si en revanche tu veux retoucher/éditer/remasteriser des fichiers mp3, la plupart des logiciels d'édition audio décompresseront les mp3 (éventuellement en mémoire cache) pour permettre de travailler dessus. Pas le choix.