slt,
lorsque tu fais une extration audio il doit donc en theorie te sortir 2 fichiers de flux audio, non? Puisqu'il semble qu'il s'agit de deux fichiers distincts.
Je supose que oui, tu reperes le fichier francais et tu decoupes l'autre, tu remuxes l'ensemble et ca devrait etre bon , mais je dis ça de façon theorique n'ayant pas le moyen de tester ton pb.
Il est evident lors de l'encodage que fairuse ou n'importe quel autres logiciels ne comprends pas la liaison entre la video et l'audio, pour lui il trouve 2 flux audio assortie a la video, donc par defaut il te colle les 2.
Par contre si tu veux conserver les 2 flux audio alors je ne sais vraiment pas qomment s'y prendre ni meme si c'est possible...
Et si par malheur le flux audio se regroupe en un seul fichier avec les 2 langues, alors là je pense que c'est mort pour extraire une piste precise.
Ta video apres encodage tu la sors en quel format, mpeg2/dvix/xvid .. ?