[BAT] Lancé des application dans le sysray par un .bat

Lal si j'ose appelé cela de la programmation...

Enfaite, je me suis fait deux fichiers .bat:
J'ai une suite de logiciel que je lance pour scané rapidemant mon disque (virus, rootkit, trojan ect...)

-dans le premier (scanON.bat) je lance toutes mes applications, et je cache le systray (c'est purement fun, pour pas être encombré !)

-dans le second (scanOFF.bat) j'arrête les programmes, je fait réapparaître le systray.

à chaque fois, je tue explorer pour le remettre pour qu'il prenne en compte la modif du registre (masque ou affich le systray)

Bref ma question est:

comment je fait pour que tout mes programmes s'ouvre dans le systray plustôt qu'en grande fenêtre ???

Je sais ça doit être con mais je suis autodidacte, alors il me manque certaines bases...