Le mieux, c'est de faire plusieurs partitions.
Pour un débutant un bon choix est :
- une partition / de 10Go en reiserfs ou ext3
- une partition /home avec le reste (au moins plusieurs Go, c'est pour tous tes documents/fichiers etc...) en reiserfs ou ext3
Comme ca, quand tu veux réinstaller une distribution linux, tu change le /, et tu laisses le /home : tes documents et tes customisations (genre la couleur du fond d'écran que t'as choisie) sont conservés.
Entre reiserfs et ext3 tu prends un peu comme tu veux, moi je conseille reiserfs mais on voit pas trop la différence en vrai.