La réponse est oui à tes deux questions ; si tu défais le partitionnement, tu n'auras plus linux, c'est tout...
Par contre, avec 98, il faut d'abor installer 98 puis linux car 98 remplace toujours le secteur de démarrage et tu risques de ne pas voir le multiboot.
Si tu dois réinstaller 98, tu dois après insérer ton cd (ou ta disquette de démarrage) linux et réparer le secteur de boot.