dr programfiles déplacé = problèmes

Bonjour
Sur un nouveau PC on a une partition de 20 go pour l'OS (C. Après installation des nouveaux programmes, il fallait déplacer le dossier ProgramFiles sur une autre partition (D pour ne pas encombrer la C:.
Sur les conseils de ce site, on a fait les modifications dans l'Editeur de Registre au niveau des commandes ProgramFilesDir et CommonFilesDir.
Ensuite, il semblait indispensable de supprimer les dossiers dans le C:, ce que nous avons fait, mais là... problèmes, il y a des fichiers qui ne veulent pas se supprimer et les restes est corrompu. Impossible de faire la démarche inverse et une restauration de Windows n'a rien donné. Il y a plein de logiciels qui ne fonctionnent pas ou indiquent un message d'erreur avant de s'ouvrir..
On comptait installer certains programmes rattachés à Windows dans le C et les autres dans le D mais la manip indiqué ici semblait résoudre le problème simplement et sans risques même si je sais qu'il y a des manip délicates...
Il faudra surement réinstaller tout mais si vous avez une idée, merci d'avance.
Vos conseils seront également bienvenus concernant le fameux dossier ProgramFiles. Merci.
Evlise